De verschillen tussen licht- en elektronenmicroscopen worden genoteerd.
Het verschil tussen een optische microscoop en een elektronenmicroscoop is dat een optische microscoop alleen bepaalde celstructuren kan zien, zoals celwanden, chloroplasten, gekleurde chromosomen, mitochondriën, kernen etc. kleine organellen. Kortom, de lichtmicroscoop kan de microscopische structuur van cellen zien en de elektronenmicroscoop kan de submicroscopische structuur zien.
Het belangrijkste verschil is de vergroting. Optische microscopen hebben een vergrotingslimiet en hoe groot de zoomlens ook is, het menselijk oog kan deze niet onderscheiden. y(min)=0.61*golflengte)/(n*sinu) —— Zelfs als n*sinu wordt ondergedompeld in olie, is het maximum ongeveer 1,5, en de rest hangt af van de grootte van de golflengte. Daarom is de maximale optische microscoop ongeveer 1000 keer, en het heeft geen zin om in te zoomen. Elektronenmicroscopen gebruiken elektronenstralen voor beeldvorming en de golflengte is veel kleiner dan die van zichtbaar licht, dus de minimale resolutieafstand y(min) is veel kleinere en kleinere details kunnen worden opgelost en de vergroting kan enkele miljoenen bedragen.
